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高效液相色譜儀是一種很精密的儀器，無論是從儀器的高壓泵角度來講，還是從檢測器角度講，都是如此。因此，它對電源的要求是較高的。

它要求交流供電電源的穩定性較高，最好使用電壓波動在5%以內的交流電子穩壓器。但是，目前我國許多使用者不懂得高效液相色譜儀對交流電源的要求，所以在市電穩定性極差的情況下，有的使用者不用交流電子穩壓器，有的雖然使用了交流電子穩壓器，但交流電子穩壓器的性能很差，在分析測試時，連肉眼都可以很明顯地看出交流電子穩壓器在大幅度波動，這些都會嚴重影響高效液相色譜儀使用時的穩定性。

使用的交流電源要求最好是(50±1)Hz的頻率。但是，許多地方采用自發電，其電源頻率很不準，有的只有45Hz左右，這是不合適的。因為儀器里面的濾波、噪聲等電路設計，都是根據(50±1)Hz的頻率來考慮的。特別是影響高效液相色譜儀分析誤差的噪聲，在很多儀器中，設計時都是主要考慮50Hz、100Hz等頻率的噪聲。